2016年度

• 学会報告
• 原著論文

学会報告

小田彰史
限られたアミノ酸のみから原始タンパク質が構築できるか？
科学研究費補助金 新学術領域研究「冥王代生命学の創成」平成28年度中規模ワークショップ（東京）平成28年7月2日

神藤彩加、石原利紗、小田彰史、栗本英治
ヒトプロテアソームα6,α7サブユニットにより形成されるリングをベースとしたタンパク質の集積化
第６２回日本薬学会東海支部大会（名古屋）平成28年7月9日

Akifumi Oda, Shuichi Fukuyoshi
Conformational Energies and Molecular Force Field Parameters for Nitronyl Nitroxide Obtained by Quantum Chemical Calculations
The 15th International Conference on Molecule-Based Magnets（Sendai）平成28年9月6日

小田彰史、福吉修一、栗本英治
D-アミノ酸を含んだ原始タンパク質の立体構造の推定
第12回D-アミノ酸学会学術講演会（高知）平成28年9月14日

仲吉朝希、福吉修一、高橋央宜、小田彰史
水分子のアシストするタンパク質内グルタミン酸残基のラセミ化反応についての計算化学的検討
第12回D-アミノ酸学会学術講演会（高知）平成28年9月14日

福吉修一、仲吉朝希、高橋央宜、小田彰史
タンパク質中グルタミン酸異性化反応経路に対する計算化学的考察
第12回D-アミノ酸学会学術講演会（高知）平成28年9月14日

伊藤暁生、齋藤雄大、長﨑正朗、齋藤さかえ、安田純、小田彰史、平澤典保、平塚真弘
全ゲノム解析から同定された CYP2C9レアバリアント解析評価
第55回日本薬学会東北支部大会（郡山）平成28年9月25日

加藤紘一、古橋隆久、小田彰史、栗本英治
酵母輸送タンパク質Emp46p/47pのコイルドコイルのプロリン変異によるpH依存的会合特性の変化
第89回日本生化学会大会（仙台）平成28年9月26日（若手優秀発表賞）

齋藤雄大、高橋理充、小田彰史、前川正充、三枝大輔、平澤典保、平塚真弘
日本人集団で新規に同定されたCYP2C19遺伝子多型バリアントの機能評価
日本薬物動態学会第31回年会（松本）平成28年10月15日

公文代將希、細野寛貴、前川正充、小田彰史、平澤典保、平塚真弘
CYP2A6遺伝子多型バリアント酵素の機能変化
日本薬物動態学会第31回年会（松本）平成28年10月15日

Tomoki Nakayoshi, Shuichi Fukuyoshi, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
A computational study of water-assisted cyclization mechanism of glutamate residue
第44回構造活性相関シンポジウム（京都）平成28年11月16日

Akifumi Oda, Shuichi Fukuyoshi, Eiji Kurimoto
Three dimensional structures of primitive proteins generated in the racemic amino acid pool
第44回構造活性相関シンポジウム（京都）平成28年11月16日

Koichi Kato, Takahisa Furuhashi, Eiji, Kurimoto, Akifumi Oda
Analysis for assembling mechanism of coiledcoil domains in yeast cargo receptor Emp46p/47p and modification of pH-dependence for the complex formation
第44回構造活性相関シンポジウム（京都）平成28年11月16日

Kenichiro Fujii, Shuichi Fukuyoshi, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Akifumi Oda
Evaluation of the structural features between estrogen receptor alpha and beta using molecular dynamics simulations
第44回構造活性相関シンポジウム（京都）平成28年11月16日

Shuichi Fukuyoshi, Tomoki Nakayoshi, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
Computational study of isomerization reaction route of the aspartic acid
第44回構造活性相関シンポジウム（京都）平成28年11月16日

仲吉朝希、福吉修一、高橋央宜、小田彰史
水分子のアシストするAsp-Pro配列におけるAspの異性化反応経路探索
日本薬学会北陸支部第128回例会（金沢）平成28年11月27日

Tomoki Nakayoshi, Shuichi Fukuyoshi, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
A computational study of racemization mechanism of aspartate residue catalyzed by phosphate ion
The 57th Sanibel Symposium（St. Simons Island, USA）平成29年2月20日

Shuichi Fukuyoshi, Tomoki Nakayoshi, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
Evaluations of Density Functionals and Solvation Effect for Racemization Reaction of Amino Acid Residues
The 57th Sanibel Symposium（St. Simons Island, USA）平成29年2月21日

小田彰史、福吉修一、栗本英治
ドッキングポーズの選別を分子動力学シミュレーションによって行うことは可能か
日本薬学会第137年会（仙台）平成29年3月25日

仲吉朝希、福吉修一、高橋央宜、小田彰史
リン酸触媒によるスクシンイミド中間体を経由しないアスパラギン酸残基のラセミ化反応機構
日本薬学会第137年会（仙台）平成29年3月25日

福吉修一、仲吉朝希、高橋央宜、小田彰史
アスパラギン酸残基のラセミ化反応における計算化学的研究
日本薬学会第137年会（仙台）平成29年3月25日

加藤紘一、池畑美帆、小田彰史、栗本英治
酵母輸送タンパク質Emp46p/47p コイルドコイルドメインのpH 依存的複合体形成における機能セグメントの抽出
日本薬学会第137年会（仙台）平成29年3月25日

栗本英治、神藤彩加、橋本友佳、小田彰史
ヒトプロテアソームα 6, α 7 サブユニットにより形成されるリングを応用したタンパク質の集積化
日本薬学会第137年会（仙台）平成29年3月25日

小田彰史、福吉修一、栗本英治
D-アミノ酸を含んだ[GADV]-ペプチドの配座探索
生命の起原および進化学会第42回学術講演会（飯塚）平成29年3月28日

原著論文

Shuichi Fukuyoshi, Masaharu Kometani, Yurie Watanabe, Masahiro Hiratsuka, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Noriyoshi Manabe, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
Molecular dynamics simulations to investigate the influences of amino acid mutations on protein three-dimensional structures of cytochrome P450 2D6.1, 2, 10, 14A, 51, and 62
PLOS ONE, 11, e0152946 (2016).

Yurie Watanabe, Shuichi Fukuyoshi, Masahiro Hiratsuka, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
Prediction of Three-dimensional Structures and Structural Flexibilities of Wild-type and Mutant Cytochrome P450 1A2 using Molecular Dynamics Simulations
J. Mol. Graph. Model., 68, 48-56 (2016).

Kyoko Nakagawa-Goto, Yukako Taniguchi, Yurie Watanabe, Akifumi Oda, Emika Ohkoshi, Ernest Hamel, Kuo-Hsiung Lee, Masuo Goto
Triethylated chromones with substituted naphthalenes as tubulin inhibitors
Bioorg. Med. Chem., 24, 6048-6057 (2016).

Hiroki Hosono, Masaki Kumondai, Masamitsu Maekawa, Hiroaki Yamaguchi, Nariyasu Mano, Akifumi Oda, Noriyasu Hirasawa, Masahiro Hiratsuka
Functional characterization of 34 CYP2A6 allelic variants by assessment of nicotine C-oxidation and coumarin 7-hydroxylation activities
Drug Metab. Dispos., 45, 279-285 (2017).

Shuichi Fukuyoshi, Tomoki Nakayoshi, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda
Theoretical Study on Keto-enol Tautomerization of Glutarimide for Exploration of the Isomerization Reaction Pathway of Glutamic Acid in Proteins Using Density Functional Theory
Mol. Phys., 115, 560-565 (2017).